SERVICII
ECHIPAMENTE
SERVICII
Servicii oferite de Centrul de Cercetări pentru Genomică Funcţională, Biomedicină şi Medicină Translaţională, Universitatea de Medicină și Farmacie „Iuliu Hațieganu” din Cluj-Napoca, Romania
| Denumirea serviciului | Descrierea serviciului |
|---|---|
Monitorizarea imagistică a creșterii celulelor |
Prin intermediul sistemului de imagistică cu fluorescentă și în de câmp de lumină normală (Celigo), specialiștii din cadrul centrului pot dezvolta proceduri standard de operare pentru monitorizarea creșterii celulelor (ciclul celular, viabilitate, co-culturi). |
Teste funcționale prin monitorizare imagistică in vitro |
Prin intermediul sistemului de imagistică cu fluorescentă și în de câmp de lumină normală (Celigo), specialiștii din cadrul centrului pot dezvolta proceduri standard de operare pentru identificarea și dezvoltarea coloniilor celulare, evaluarea migrării și a invaziei celulare. |
Evaluarea imagistică a culturilor celulare 3D |
Prin intermediul sistemului de imagistică cu fluorescentă și în de câmp de lumină normală (Celigo), specialiștii din cadrul centrului pot dezvolta proceduri standard de operare pentru dezvoltarea și evaluarea formării sferoizilor, organoizi și a culturilor 3D. |
Extracție automată de ADN, din diferite matrici biologice |
Extracția automată de ADN, cu ajutorul sistemului Maxwell® RSC, în timp scurt (maxim 60 minute), din diferite probe biologice precum țesut, sânge, urină, salivă și linii celulare. |
Extracție automată de ARN, din diferite matrici biologice |
Extracția automată de ARN, cu ajutorul sistemului Maxwell® RSC, în timp scurt (maxim 60 minute), din diferite probe biologice precum țesut, sânge, urină, salivă și linii celulare. |
Serviciu de consultanță |
Specialiștii din cadrul centrului nostru oferă consultanță, atât pentru colaboratorii interni (din cadrul universității), cât și pentru colaboratorii externi (naționali și internaționali), pentru elaborarea diverselor design-uri de studii, procesarea, analiza probelor biologice și interpretarea rezultatelor obținute, precum și diseminarea activităților de cercetare. De asemenea, prin vasta experiență acumulată de-a lungul timpului, echipa asigură consultanța în elaborarea aplicațiilor științifice pentru diferite competiții pe teme medicale/ științifice/ inovatoare, naționale și internaționale. |
Sistemul QIAcuity Digital PCR – variatia numarului de copii |
Poate detecta cu ușurință diferențe mici FC, de mai mici de 1,2 ori FC în CNV de la patru la cinci copii, fără a necesita o curbă standard. Precizia și sensibilitatea tehnologiei permit sistemului să distingă modificările fine ale numărului de copii. Acuratetea este mai puțin sensibilă la modificările eficienței amplificării și la prezența inhibitorilor. Utilizările emergente ale dPCR pentru CNV sunt potrivite domeniului cercetării cancerului (screening și monitorizare a biomarkerilor cancerului), cercetării în condiții neurologice și studiilor populațiilor. |
Sistemul QIAcuity Digital PCR – expresia genica, analiza lncRNA si miRNA |
DPCR oferă cuantificarea absolută a expresiei genelor și a nivelurilor de expresie lncRNA sau miRNA, în special a țintelor cu abundenta scăzuta. Precizia crescută a dPCR poate oferi o analiză a expresiei genelor de rezoluție mai mare, permițând monitorizarea modificărilor mai fine ale nivelurilor de expresie. Alte aplicații sunt:
|
Sistemul QIAcuity Digital PCR – detectia mutatiilor rare |
DPCR permite detectarea și cuantificarea absolută a evenimentelor rare/ variantelor de secvență, deoarece partiționarea permite o creștere a concentrației specifice a țintei. În plus, amplificarea punctului final și detectarea zgomotului, cu o apelare binară pozitivă/ negativă a țintei, permit o cuantificare precisă mai independentă de performanța de amplificare (de exemplu, prin inhibitori PCR). Utilizările emergente ale dPCR pentru detectarea mutațiilor rare includ:
|
Diagnostic COVID – Test RT PCR |
După prelevarea probelor din tractul respirator superior (exsudat nazofaringian) aceste probe sunt folosite pentru extracția ARN total și identificarea prezenței virusului Sars-Cov2 prin metoda RT-PCR utilizând teste RT-PCR aprobate pentru diagnostic. |
Procesare probe si biobanking |
Laboratorul nostru este capabil să prelucreze diferite tipuri de matrici biologice, în condiții standardizate. Probele de sânge sunt procesate pentru a obține ser, plasmă și pelete leucocitare. În primul rând, pentru ser, probele trebuie să fie recoltate în flacoane fără anticoagulant, în timp ce pentru plasma și pelete leucocitare, probele sunt recoltate în tuburi cu EDTA. Extractul de leucocite este transferat în soluție de TriReagent și păstrat la -80°C până când este utilizat pentru extracția acidului nucleic. Probele de ser și plasmă sunt alicotate în 500 μl și depozitate la -80°C. Probele pot fi depozitate în ultracongelator și în rezervorul de azot lichid pentru diferite perioade de timp (luni – ani). |
Extracție de acizi nucleici |
Extracția acizilor nucleici poate fi efectuată din diferite tipuri de matrici biologice, cum ar fi țesutul proaspăt sau congelat, țesutul din parafina, culturile celulare, sângele integral sau pelet leucocitar, chiar serul/plasma sau alte fluide biologice. Pentru extractia de acizi nucleici, putem folosi fie metoda tradițională de cloroform/izopropanol, fie kituri specifice. Extracția acizilor nucleici se realizează cu una dintre metodele disponibile, luând în considerare tipul de analiză pentru care se va utiliza eșantionul de acid nucleic, precum și tipul de specimen biologic și tipul de metodă utilizat pentru evaluarea markerului specific. |
Controlul calității acizilor nucleici și a proteinelor cu ajutorul Nanotropului ND-2000 și Bioanalizorului Agilent 2100 |
NanoDrop 2000c poate fi utilizat pentru cuantificarea acizilor nucleici și a proteinelor. Pentru acizii nucleici se evaluează raportul A260/A280 și A260/A230, doi parametri importanți, corelati cu gradul de contaminare cu proteine și solvenți organici. De asemenea, permite evaluarea testelor toxicologice, a testelor proteice colorimetrice, a măsurătorilor densității optice și a cuantificării nanoparticulelor de aur. Bioanalizorul Agilent 2100 este standard pentru controlul de calitate a probei de ARN și a înlocuit electroforeza cu gel, pentru această aplicație. În același timp, această platformă poate fi utilizată pentru fragmentarea ADN-ului, cuantificarea proteinelor sau citometria fluxului. Bioanalizatorul Agilent 2100 ajută la optimizarea reacțiilor PCR pentru exprimarea genelor, secvențierea, clonarea și analiza, oferă o sensibilitate mai mare, o precizie de dimensionare îmbunătățită și o cuantificare automată, reproductibilă, în comparație cu electroforeza în gel, care este esențială pentru toate studiile genomice și transcriptomice. De asemenea, se înlocuiește rapid electroforeza în gel pentru analiza fragmentelor ADN și analiza probelor de proteine. O caracteristică unică a bioanalizorului Agilent 2100 este că poate fi utilizat atât pentru separarea electroforetică, cât și pentru analiza citometrică a parametrilor fluorescenței celulare utilizând colorare cu Annexin-Cy5/PI. Există câteva avantaje, inclusiv precizia și reproductibilitatea îmbunătățită a datelor, timpii de analiză scurți, consumul minim de probe, automatizarea îmbunătățită și integrarea fluxurilor de lucru complexe. |
Izolarea unei populații de celule specifice cu ajutorul microdisecției laser |
Sistemul de microdisecție cu laser este un instrument important al cercetătorilor care au dorit fără efort să izoleze grupuri de celule, celule individuale și componente celulare pentru analiză, într-o gamă largă de aplicații. Este utilizat pentru separarea unei populații de celule pure pentru studii de profilare moleculară. Pot fi identificate, tăiate și izolate celule individuale sau alte entități citologice relevante. Alte aplicații ar fi: potrivirea celulei izolate și a eșantionului rămas în documentarea preciziei și eficienței izolării; localizarea și curățarea structurilor microdisecate mai mici decât celulele individuale; izolarea celulelor specifice de fibroblastii adiacenti. Acest sistem permite microdisecția celulelor de interes, fără nici o deteriorare. |
Evaluarea markerilor prin microscopia de fluorescenta |
Microscopia de fluorescenta reprezinta un instrument important, complementar altor tehnici de biologie moleculara si poate fi folosit pentru a eticheta specific o structura selectata dintr-o celula sau dintr-un fragment de tesut Aplicații: Teste de viabilitate celulară, teste de apoptoză, teste de migrare celulară și invazie. Microscop de scanare laser confocal Olympus Fluoview 1200 permite imagistica celulelor fixe, vii cu niveluri ridicate de sensibilitate, folosind putere laser redusă. Folosind această tehnică, se poate confirma exprimarea și localizarea proteinelor sau antigenilor specifici. Se pot rula teste semicantitative bazate pe intensitatea fluorescenței. Alte aplicații includ modificări morfologice celulare induse in vitro de anumiți compuși. Această tehnică este ideală pentru vizualizarea celulelor vii, a țesuturilor și a sistemelor de cultură celulară 3D, cum ar fi organoidele și sferoidele. |
| Toxicologia celulară, invazia și evaluarea migrației utilizand sistemul xCELLigence (ACEA Biosciences)https://eertis.eu/ersv-2300-000w-1728 |
Sistemul xCELLigence este un sistem microelectronic biosenzor pentru analize celulare, oferind analize celulare dinamice, în timp real, pentru o varietate de aplicații de cercetare în domeniul dezvoltării medicamentelor, toxicologiei, invaziei celulare și migrației sau aplicării de co-cultură. Această tehnologie permite cercetătorilor să crească productivitatea și să depășească limitele analizei finale prin captarea datelor pe parcursul întregului ciclu de timp al unui experiment și obținerea unor date mai relevante din punct de vedere fiziologic. Într-un format flexibil, acesta adăpostește până la trei 16 plăci (plăci electronice sau plăci CIM), rulând experimentul simultan sau independent pentru o gamă largă de aplicații toxicologice, de invazie și migrare. |
UV-VIS, determinarea fluorescenței și a luminescenței cu ajutorul unui cititor de microplăci Biotek |
Cititorul de microplăci este un instrument utilizat pentru a detecta evenimentele biologice, chimice sau fizice ale eșantioanelor pe plăci de microtitrare. Acestea sunt utilizate pe scară largă în cercetare, descoperirea medicamentelor, validarea biotestului, controlul calității. Reacțiile pot fi realizate pe plăci de microtitrare de 6-96. Cititorul de microplăci poate fi utilizat pentru determinarea proteinelor, cinetica enzimatică, testele toxicologice celulare (testul MTT, eliberarea activității LDH), speciile reactive de oxigen (testul diclorofluoresceină) și cuantificarea unei game largi de produse metabolice pe baza testelor imunenzimatice. |
Caracterizarea populațiilor de celule prin citometrie de flux utilizând FACS BD Canto II |
Citometria în flux (folosind BD FACSCantoII) este o tehnologie care măsoară și analizează simultan mai multe caracteristici fizice ale particulelor individuale, de obicei celule, pe măsură ce acestea curg într-un flux de fluide printr-un fascicul de lumină. Citometria în flux oferă o analiză rapidă a mai multor caracteristici ale celulelor individuale. Citometria în flux permite o gamă largă de aplicații clinice: În hematologie (analiza eritrocitelor, analiza leucocitelor, analiza plachetelor, leucemia și fenotiparea limfomului (antigene de suprafață leucocitelor), identificarea markerilor prognostici în subgrupuri importante (TDT, MPO), enumerarea celulelor progenitoare hematopoietice (CD34), diagnosticul de mastocitoză sistemică (CD25, CD69), anticorpi antiplachetari (IgG, IgM), anti-neutrofile (IgG), IgG (IgE) Complexe imune (complement, IgG), în imunologie (încrucișare cu histocompatibilitate (IgG, IgM), respingerea transplantului (CD3, OKT3 circulant), detectarea HLA B27 (HLA B27); Studii de imunodeficiență (CD4, CD8), în oncologie (conținutul ADN și faza S a tumorilor (ADN), măsurarea markerilor de proliferare (Ki- 671, PCNA), în tulburări genetice (PNH (CD55, CD59), deficit de adeziune leucocitară (complex CD11/CD18). Testele funcționale sunt:
|
Aplicația microarray în cercetarea biomedicală |
Laboratorul Microarray este complet echipat cu toate instrumentele pentru a efectua analize micromatrice cu cea mai recentă versiune de tehnologie Agilent (SureScan Microarray Scanner/G4900DA de la Agilent Technologies – protecție încorporată în ozon pentru a reduce la minimum degradarea semnalului și capacitatea de încărcare continuă a lamelor) și oferă un serviciu complet, inclusizand:
Serviciile de microarray includ: |
Evaluarea modelului mutațional și transcriptomic utilizând secvențierea de noua generație |
Laboratorul de secventiere este echipat cu un aparat Ion Torrent și un secventiator Illumina NextSeq 550 care poate fi utilizat pentru diferite tipuri de experimente NGS, cum ar fi:
Aplicațiile țintite de secvențiere și secvențiere miARN se fac pe secventiatorul Ion Torrent, iar toate experimentele de exom și transcriptom se fac pe Illumina NexSeq 550. |
Profilarea moleculară și validarea datelor utilizând nCounter Nanostring |
Sistemul nCounter de la Nanostring Technologies este un sistem complet automatizat pentru a determina profile mARN, microARN-uri sau ținte ADN simultan cu sensibilitate și precizie ridicată, nu numai pentru studiile de profilare moleculară, ci și pentru validarea datelor experimentale (în special cele generate de experimente cu micromatrice și NGS). Tehnologia NanoString NCounter utilizează coduri de bare moleculare codificate prin culori, care pot hibridiza direct la diferite tipuri de molecule țintă. Acest sistem are mai multe avantaje, cum ar fi: utilizeaza cantități mici de material (100 ng de ADN total ARN⁄probă) / 600 ng; capacitatea de a analiza probele de ARN de calitate slabă; poate evalua peste 800 transcrieri per probă simultan; nu sunt implicate reacții enzimatice, într-un interval dinamic ridicat, sensibilitate și reproductibilitate. Principalele aplicații sunt:
|
Amplificarea PCR Veriti Thermal Cycler (Thermo Fisher Scientific) |
Reacția în lanț a polimerazei (PCR) este o tehnologie utilizata in biologia moleculară pentru a amplifica o singură copie sau câteva copii ale unui fragment de ADN, generând mii până la milioane de copii ale unei anumite secvențe de ADN. PCR permite izolarea fragmentelor de ADN din ADN genomic prin amplificarea selectivă a unei anumite regiuni de ADN utilizând primeri specifici, utilizați pentru aplicații moleculare. |
Evaluările PCR în timp real utilizând sistemul LightCycleric 480 RT PCR (Roche), VIIa-7 RT-PCR (Applied Biosystems) |
PCR în timp real permite monitorizarea produsului dorit în orice punct al procesului de amplificare prin măsurarea fluorescenței. Acesta monitorizează amplificarea unei molecule de ADN vizate în timpul reacției în lanț a polimerazei, în timp real. PCR în timp real este utilizat pentru detectarea și cuantificarea sensibilă, specifică a țintelor de acid nucleic. Acesta include o gamă largă de aplicații, începând cu expresia genică sau non-codarea ARN (ncRNA, miARN), analiza variației genetice (genotiparea SNP, genotiparea enzimei metabolismului medicamentului, analiza variației numărului de copii) și starea metilării genei. Acesta poate fi utilizat fie cu reactivi TaqMan, fie cu SybrGreen. |
Evaluarea proteinelor prin tehnica Western Blot |
Tehnica Western Blot este utilizata pentru evaluarea proteinelor din lizatul de celule/ țesuturi utilizând geluri SDS-poliacrilamide, urmată de transferul către membrana nitroceluloză. Membrana este marcată cu anticorpi primari și secundari, iar proteinele sunt identificate fie prin detecție chemiluminiscentă, fie prin detecție vizibilă. Această tehnică poate fi aplicată în diferite tipuri de proiecte, cum ar fi validarea datelor RT-PCR la nivel proteic sau identificarea proteinelor specifice. Pentru acest serviciu folosim sistemul celular Mini-PROTEAN tetra, iar membranele sunt vizualizate folosind sistemul de vizualizare Azure Gel. |
Determinarea proteinelor prin tehnica ELISA |
Tehnica ELISA este un format popular al testului biochimic analitic de tip „laborator umed” care utilizează un imunotest enzimatic în fază solidă pentru a detecta prezența unei substanțe, de obicei un antigen, într-o probă lichidă sau o probă umedă. Această tehnică este utilizată adesea în identificarea proteinelor atât cantitativ, cât și calitativ, precum și în validarea datelor transcriptom la nivelul proteinei. Putem efectua ELISA pe bază de kit, ELISA indirect sau sandwich. Plăcile ELISA se citesc pe spectrofotometrele Spectral Max 19 sau Biotek. |
Determinarea proteinelor folosind sistemul AB SCIEX triplu Quad 4500 |
Sistemul TripleQuadruple 4500 este un instrument robust și fiabil și are performanțe îmbunătățite pentru toți parametrii critici: sensibilitate, interval dinamic, performanță liniară, viteză mare de scanare. Există unele avantaje, cum ar fi sensibilitatea MRM îmbunătățită cu 10X față de quadurile triple competitive din aceeași clasă, integrarea optimizată cu strategiile UHPLC cu viteze de scanare de până la 12,000 Da/sec, obtinerea mai multor date obținute pentru un anumit vârf UHPLC, reproductibilitate îmbunătățită a testului, deteminarea mai multor compuși ecranați, cu timpi de așteptare de 1 milisecunde. Acest sistem permite o gamă largă de aplicații pentru mii de compuși purificati, fie prin focalizare izoelectrică, fie prin alte metode specifice. Diferitele aplicații ale proteomicii includ descoperirea biomarkerilor proteici pentru identificarea biomarkerilor potențiali ai bolilor în diagnosticul molecular și prognostic. |
Vectori de expresie genică personalizați |
Laboratorul nostru este capabil să proiecteze și să producă vectori plasmid și vectori lentivali (generația a 2-a și a 3-a) pentru expresie transgenică constitutivă și reglementată în linia celulară și modele animale. Vectorii au capabilitati de editare a genomului folosind CRISPR/Cas9 si pot fi furnizati pentru utilizare in cercetare, in directia biomedicala fundamentala. |
Clone celulare stabile |
Serviciul oferă linii de celule monoclonale stabile care exprimă transgene de interes, cum ar fi gene reporter sau alte gene la cerere. |
ECHIPAMENTE
Echipamentele din dotarea Centrului de Cercetări pentru Genomică Funcţională, Biomedicină şi Medicină Translaţională, Universitatea de Medicină și Farmacie „Iuliu Hațieganu” din Cluj-Napoca, Romania
| Denumirea echipamentului | Descrierea echipamentului |
|---|---|
| Sistem de imagistică Celigo | Sistem de evaluare imagistică automată, analiză și caracterizare a celulelor aderente și în suspensie, atât în câmp de lumină normală, cât și prin fluorescență. Sistemele optice și de scanare brevetate ale sistemului permit o evaluare rapidă a întregului godeu utilizat, menținând în același timp o iluminare și un contrast constant până la marginea godeului, pentru identificarea precisă a tuturor celulelor din fiecare godeu. |
| Sistem QIAcuity Digital PCR (5plex Device) | Sistemul QIAcuity este destinat aplicațiilor de biologie moleculară. Prezintă un sistem avansat integrat ce conduce la fluidizarea întregului flux de lucru PCR, într-un singur instrument, cu un timp minim de lucru, asigurând configurarea rapidă a analizei, respectiv obținerea rezultatelor. |
| Sistem de extracție automată Maxwell® RSC | Echipamentul permite extracția automată de acizi nucleici, din diferite matrici biologice, având un sistem integrat de cuantificare. Se asigură o calitate superioară a acizilor extrași urmând un număr redus de pași, un sistem performant integrat Quantus pentru cuantificare și un software/ interfață intuitivă. |
| Sistem de electroforeza Mini-PROTEAN | Sistemul de efectroforeza Mini-PROTEAN Tetra Cell este ideal pentru electroforeza verticală in gel. Acesta poate fi utilizat fie cu geluri prefabricate, fie pregatite manual. Celula de electroforeză corespunde la 1-4 geluri 10.0×8. Sistemul de electroforeză mini-PROTEAN este compus din: sursa, rezervor cu capac, piepteni, desprindere de gel, plăci distanțiere, plăci scurte, ghid de încărcare a probelor, cadru de turnare și stand de turnare. Modulele acestor sisteme de electroforeză sunt interschimbabile și prin schimbarea modulului de electroforeză cu modulul mini-Trans lot, se poate efectua analiza Western Blot. |
| Sistem ROTEAN® i12™ IEF | Sistemul PROTEAN i12 IEF este utilizat pentru focalizare izoelectrică (IEF) pe benzi cu gradient de pH imobilizat (IPG) pentru prima dimensiune a analizei proteice electroforetice bidimensionale. Celula PROTEAN i12 IEF poate rula benzi 1–12 IPG în 7, 11, 13, 17, 18, și tăvi de focalizare de 24 cm. Fiecare canal din tava de focalizare i12™ este alimentat de propria sursă de alimentare, permițând un control precis asupra fiecărei benzi IPG. Acest lucru face posibilă rularea în același timp a diferitelor tipuri de probe, a diferitelor gradienți și a mai multor protocoale. Tăvile de focalizare i12 și ansamblurile de electrozi permit toate configurațiile posibile de gel. Celula este complet programabila din interfata cu utilizatorul; nu este necesara conectarea la un calculator extern. |
| Aparat de microfiltrare Bio-Dot | Aparatul de microfiltrare 96 Well Bio-Dot oferă metode ușor reproductibile pentru legarea pe membrane a proteinelor sau acizilor nucleici aflate soluție. Se pot utiliza mai multe protocoale experimentale folosind șabloane interschimbabile. Aparatul este disponibil ca un sistem complet compus: din aparatură Bio-Dot, garnitură Bio-Dot, robinet și tubulatură. Sistemul are următoarele caracteristici: Rezistență la etanol 100%, acizi puternici și NaOH; autoclavabilitate; garnitură de etanșare brevetată pentru a elimina scurgerile laterale; aplicare ușoară a probei cu spațiere pe bază de microplăci; supapă de debit (3way) pentru vid reglabil. |
| Cititor de microplaci SpectraMax 190 | Designul optic multicanal patentat al cititorului de microplăci de absorbție SpectraMax 190 imită un spectrofotometru cu fascicul dublu, măsoară fiecare eșantion direct în placă și elimină erorile de măsurare cauzate de variațiile de lumină dintre fibrele optice de pe alte instrumente, pentru o raportare mai fiabilă a datelor. Cititorul de microplăci SpectraMax 190 susține o multitudine de categorii de analize ale absorbanței, incluzand: viabilitatea celulară, proliferarea și citotoxicitatea; testele ELISA și evaluarile imunologice; detectarea endotoxinei; teste enzimatice; creștere microbiană; aplicații în micro-volum; cuantificare de acid nucleic (ADN); Fosfataze/kinaze; cuantificare proteică. |
| Fluorometru QUBIT 2.0 | Fluorometrul Qubit® 2.0 este un fluorometru de referință pentru cuantificarea ADN, ARN și proteine, utilizând testele de cuantificare Qbit™ foarte sensibile și precise, bazate pe fluorescență. Utilizarea coloranților de ultimă generație selectivi pentru dsADN, ARN și proteine, reduce la minimum efectele contaminanților care afectează cuantificarea. |
| NanoDrop 2000C | Spectrofotometrul Thermo Scientific NanoDrop 2000c UV-VIS este capabil să cuantifice ADN, ARN și proteine cu capacități îmbunătățite, oferind posibilitatea de a lucra la nivel de microvolum, cât și de a măsura in cuva. Stația de cuvă este ideală pentru măsurarea dilutiei probelor de acizi nucleici și proteine, include capacități de încălzire și microagitare și permite utilizatorilor să efectueze măsurători de cinetică și cultură celulară (600nm). Acesta prezintă o gamă spectrală largă (190-840nm) pentru măsurarea unei varietăți de tipuri de eșantioane: peptide (205nm), ADN și ARN (260nm), proteine purificate (280nm), teste de toxicologie și coloranți industriali (490nm), nanoparticule de aur (520nm), teste proteice colorimetrice (BCA 562nm, Bradford 595nm, Lowry 650nm, măsurători optice (650nm), 660 nm). |
| Echipament Ion Torrent Personal Genome | Secventiatorul Ion Torrent PGM a fost fabricat pentru prima dată în 2010 de către Life Technologies și este un echipament care utilizează secvențierea prin metoda de sinteză și emulsia PCR. Pentru identificarea fiecărui nucleotid adăugat în timpul secvențierii, se utilizează măsurătorile ionilor H+ care sunt eliberate în timpul încorporării de bază. Acest secventiator are un ciclu de lucru rapid de aproximativ 2 ore, iar reactivii sunt mai puțin costisitori decât pentru alte platforme. Acest instrument funcționează cu 3 tipuri de cipuri semiconductoare (314, 316 și 318) și este utilizat în principal pentru secvențierea genomului mic și secvențierea țintită. Echipamentul PGM Ion Torrent poate fi de asemenea utilizat pentru secvențierea mARN sau miARN și secvențierea se realizeaza utilizand cip318. |
| Sistem CASY | Celulele suspendate în CASYton, un tampon electrolitic, sunt aspirate printr-un capilar de măsurare, de precizie cu o dimensiune definită. În timp ce trec prin capilarul de măsurare, acestea sunt scanate cu o frecvență de 1 milion de măsurători pe secundă într-un câmp de joasă tensiune între doi electrozi de platină. Semnalele electrice rezultate, generate de o celulă care trece prin capilar de măsurare, sunt analizate în ceea ce privește amplitudinea, lățimea impulsului, cursul timpului și aria impulsului rezultat. Zonele de puls analizate ale semnalelor celulare sunt cumulate și atribuite într-un analizor multi-canal calibrat care are 512.000 canale de dimensiuni diferențiate. |
| PCR – LightCycler 480 II | Sistemul utilizează o tehnologie nouă pentru a permite încălzirea și răcirea rapidă, necesare pentru a finaliza 40 de cicluri, în mai puțin de 40 minute. Instrumentul este ușor personalizabil pentru a satisface cerințele utilizatorilor și poate fi integrat în utilizarea de zi cu zi ca o soluție de mare debit, automat. Pe baza unei îmbunătățiri a tehnologiei Peltier, utilizând tehnologia Therma-Base cu egalizare de căldură încorporată într-un bloc, instrumentul LightCycler® 480 oferă o omogenitate extraordinară a temperaturii a placilor și o reproductibilitate maximizată inter-cicluri. LightCycler 480 II Roche este utilizat pentru: analiza genotipării, exprimarea genelor și analiza mutagenezei expresiei genice, analiza miARN și non-codarea ARN, genotiparea SNP, identificarea mutațiilor genetice cheie în anumite tipuri de cancer, evaluarea numărului de copii ADN în probele studiate. |
| Numarator NanoString nCounter | Sistemul de analiză nCounter DX este format din două instrumente: stația de pregătire și analizorul digital. Stația de pregătire include, un suport pentru vârful pipetei, un recipient pentru deșeuri lichide, un recipient pentru deșeuri solide și vaselină siliconică. Stația de pregătire este un robot de pipetare multicanal configurat special pentru utilizare cu kiturile de testare NanoString nCounter. Instrumentul efectuează transferuri lichide, separări ale talonului magnetic și imobilizarea matricilor moleculare pe suprafața cartușului de probă. Analizorul digital este un scaner de epifluorescență cu mai multe canale, configurat special pentru utilizare cu cartușele nCounter Test Kit NanoString. |
| Echipament ViiA 7 AB Applied Biosystem | Sistemul RT-PCR ViiA7 a fost conceput pentru a îmbunătăți productivitatea cercetătorilor. Aceasta implica schimbarea expresiei genei ca răspuns la agenții farmacologici și modul în care variația genetică influențează răspunsul la tratamente, pentru diverse boli. Cu un flux de lucru simplificat, software intuitiv, interfață cu ecran tactil și protocoale pentru minimizarea erorilor, sistemul VIIa™ 7 oferă o reproductibilitate excepțională, cu o variație minimă. Compatibilitatea completă cu orice plăci, standard sau cu 384 cicluri rapide, reactivii TaqMan® Array Micro Fluidic, face ca sistemul PCR în timp real sa fie de înaltă productivitate, să fie accesibil oricărui laborator. |
| Echipament PCR Verity 96-Well | Echipamentul Verity 96-well Termal Cycler este folosit pentru a amplifica fragmente specifice de ADN. Beneficiile includ optimizarea echipamentului, setarea unei temperaturi specifice, necesare pentru un control precis asupra determinarilor PCR. Blocurile Eriflex™ oferă 6 locatii de temperatură independente pentru un control precis asupra optimizării PCR. Spre deosebire de blocurile de gradient tradiționale, echipamentul Verity® nu este conectat la un algoritm pentru a genera un « gradient » al temperaturilor. Probele pot fi incubate la șase temperaturi diferite în același timp. Verity96 Cycler asigura scurtarea timpului de rulare PCR , avand opțiuni pentru a rula rapid protocoale standard PCR. |
| Cititor multimodal de microplaci Synergy H1 Hybrid | Synergy™ H1 este un cititor de microplăci multimod flexibil, bazat pe un monocromator, care poate fi transformat într-un sistem hibrid patentat de înaltă performanță, cu adăugarea unui modul optic. Sistemul monocromator utilizează un design optic cvadruplu, de generația a treia, care permite lucrul la orice excitație sau lungime de undă de emisie, cu un pas de 1 nm. Acest sistem ruleaza la intensitati ale fluorescentei ce variaza de la superior la inferior, absorbanta vizibila UV si detectarea luminescentei de inalta performanta. Este sistemul ideal pentru toate aplicațiile standard de microplăci găsite în laboratoarele de cercetare științifice. Acest modul suporta moduri avansate de detectie, cum ar fi polarizarea fluorescentei, fluorescenta – in timp si luminescenta. Este disponibil un sistem cu dubla injectare a reactivului, pentru a automatiza testele de injectare/ citire, cum ar fi testele pentru canalele de ioni sau testele de luminescență flash. |
| Separator automat MACS® Pro | Separatorul AutoMACS® Pro este un instrument de referință pentru sortarea magnetica de celule, de mare viteză. Este compatibil cu peste 250 de reactivi de separare a celulelor MAC, pentru izolarea ușoară și rapidă a aproape oricărui tip de celulă, din orice specie. Sistemul permite sortarea celulelor direct din sângele integral sau din măduva osoasă, fără a fi necesară centrifugarea gradientului de densitate sau liza eritrocitelor. Compatibilitatea tehnologiei MAC cu citometria în flux, permite utilizarea separatorului AutoMACS Pro ca alternativă la sortarea în flux. Alternativ, separatorul AutoMACS Pro poate fi utilizat ca presortare pentru accelerarea sortării fluxului. Instrumentul este operat prin intermediul ecranului tactil și al unor meniuri intuitive. |
| Bioanalizor 2100 Bioanalyzer | Sistemul de electroforeza Agilent 2100 asigură separarea electroforetică, analiza calitativă și cantitativă a fragmentelor de analiză ADN/ARN/proteine și analiza celulară (modulul citometriei în flux). Sistemul oferă două tipuri de analize: electroforeza și analiza celulelor pe un cip (citometria de flux, pe 2 culori). Sistemul utilizează kituri de reactivi gata de preparati pentru utilizare, are un consum redus de probe (1-4 ml), si este ușor de manevrat. Datele digitale obtinute sunt prezentate in mai multe forme: imagini de electroforeză în gel, electroforegram, tabele, etc. Are cartușe interschimbabile pentru a evita contaminarea. Bioanalizorul Agilent 2100 reprezintă standardul cel mai inalt în evaluările calitative ale probelor de acizi nucleici și proteine și înlocuiește cu succes analiza electroforezei în gel pentru analiza ADN / ARN sau SDS-PAGE a probelor de proteine. |
| Citometria de flux BD FacsCanto II | Citometria de flux este utilizată pentru imunofenotiparea unei game largi de matrici biologice, inclusiv sânge integral, măduvă osoasă, lichid cefalorahidian, urină și țesuturi solide. Caracteristicile care pot fi măsurate includ dimensiunea celulei, complexitatea citoplasmatică, conținutul de ADN sau ARN și o gamă largă de proteine intracelulare și legate de membrană. Citometria de flux este utilizată în mai multe domenii, cum ar fi imunologia, oncologia și hematologia. |
| Microarray | Scanerul SureScan Microarray este un scaner laser de fluorescență, conceput pentru a citi microarray-uri imprimate pe lamele de sticlă standard de 1 inch x 3 inch. Măsoară simultan intensitatea fluorescenței a doi coloranți din proba de acid nucleic marcata. Platforma microarray este punctul central al unei facilități genomice moderne, oferind instrumente de ultimă oră pentru a efectua cercetări moleculare. Rezoluția variază de la 1 la 10 microni, în timp este permisa încărcarea a până la 24 de lamele, în același timp. SureScan de la Agilent efectuează scanări rapide ale lamelelor: achiziție simultană în două culori a datelor în 16 minute per pentru scanări de 3 microni și 24 minute pentru scanări de 2 microni (regiune de scanare de 61 mm x 21.6 mm). |
| Spectrometru de masa Qtrap 4500 (proteomica) | Proteomica este un domeniu nou utilizat in practic medicala, care se ocupă cu cercetarea structurii și funcției proteinelor. Acest echipament permite determinarea structurii și funcției proteinelor, identificarea de noi biomarkeri (microARN, proteine), realizarea diagnosticului molecular al cancerului și bolilor autoimune, anticipând dezvoltarea și progresia bolii, identificarea noilor strategii terapeutice, in diferite conditii – clasificarea si alegerea tratamentului pentru pacientii cu boli autoimune si oncologice, stabilirea unor noi strategii terapeutice in cancer, identificarea si cuantificarea proteinelor din celule, tesuturi si fluide, pentru identificarea noilor biomarkeri de diagnostic, analiza modificărilor expresiei proteinelor în celulele normale în comparație cu celulele patologice, studiul interacțiunilor proteice, caracterizarea modificărilor post-translaționale. |
| Echipament xCELLigence RTCA DP | Instrumentul xCELLigence RTCA DP analizează funcțiile celulare utilizând măsurători nedistructive ale impedanței, în timp real, detectand evenimente pe termen scurt. Instrumentul utilizează măsurători de impedanță pentru a monitoriza creșterea celulelor sau modificările de deces și morfologie, utilizând 2000 până la 60000 celule per placa, în funcție de linia celulară. Sistemul este utilizat pentru testele de invazie celulară și de migrare, citotoxicitate mediată de compuși și celule, adeziune celulară și răspândire celulară, proliferare celulară și diferențiere celulară, semnalizare mediată de receptor, citopatogenicitate mediată de virus, controlul continuu al calității celulelor. Se analizează o gamă largă de parametri, inclusiv determinarea IC50 dependentă de timp, alte analize statistice bazate pe software-ul sistemului. |
| Microscop de fluorescenta inversat OLYMPUS IX71 | Pe măsură ce sunt dezvoltate noi fluorocromuri și noi metode de excitație și manipulare a luminii, devenind tot mai populare pentru experimentele celulare, tot mai mulți cercetători necesita utilizarea unor lungimi de undă fototoxice joase în apropierea IR, în plus față de spectrul vizibil convențional. Olympus și-a echipat microscoapele din seria IX2 cu noul sistem optic UIS2 tocmai pentru a satisface aceste cerințe. Cu raportul ridicat S/N, compensarea pentru aberațiile cromatice pe o lungime de undă mult mai largă și transmisia sa plată, ridicată, acest nou sistem stabilește un nou standard mondial de performanță a fluorescenței — detectând eficient chiar și semnalele slabe de fluorescență, fără a deteriora celula și optimizând observarea multi-color. Oferind o calitate fără precedent a imaginii, pe un spectru de lumină super larg, microscopul inversat IX, este instrumentul ales pentru experimente celulare. |
| Microscop confocal OLYMPUS FLOVIEW FV1200MPE/FV1200 | Imagistica țesuturilor vii necesită cele mai înalte niveluri de sensibilitate, care sa permita reducerea puterii laser, fototoxicitate și fotoalbirea, precum și abordări inovatoare pentru măsurarea indicatorilor de fluorescența. Noul FV1200 oferă un debit crescut de lumină de scanare, tehnologie de detectare cu sensibilitate ridicată și valorifică avantajele platformei de microscop inversat automat, recent introdusă. Îmbunătățirile din tehnologia detectorului și a domeniului de acoperire, permit până la cinci canale de detecție fluorescente simultane. Scanerul dedicat, de stimulare a luminii laser (scaner SIM), realizează stimularea și imagistica simultană pentru vizualizarea în timp real a răspunsurilor rapide ale celulelor. Această coordonare a stimulării și imagisticii cu laserul face din FV1200 o alegere ideală pentru FRAP, FLIP și fotoactivare. |
| Sistem de microdisectie Laser Capture MMI CellCut Plus | Sistemul de microdisectie MMI CellCut combină mai multe tehnologii de vârf în furnizarea de secțiuni, extrem de rapid și precise, dintr-o gamă largă de probe microscopice. Acest lucru se realizează prin disecarea zonelor de interes cu un laser UV-ultraprecis, menținând în același timp morfologia acestuia și asigurând calitatea materialului sursă pentru analiza ulterioară, fără inducerea inutilă a forțelor fizice sau chimice. |
| Sistem de dilutie BabyGravimat | Instrumentul BabyGravimat este destinat pentru a face diluții simple sau seriale ale unor eșantioane biologice/ farmaceutice pentru analiză microbiologică. Acesta este echipat cu o scală de ponderare a eșantionului într-un loc special și cu un sistem de dozare pentru diluent. |
| Mixer de omogenizare BagMixer CC | Instrumentul BagSystem este utilizat pentru omogenizarea probelor biologice / farmaceutice într-un recipient special. Acesta este echipat cu un ecran LCD și parametri programabili pentru viteza și timpul de omogenizare a eșantionului. |
| Sistem automat de insamantare bacteriana EasySpiral | Instrumentul easySpiral este un sistem de insamantare automatizată a probelor microbiologice pe cutiile Petri. Volumul probei poate fi programat intre 50-200 μl. De asemenea, instrumentul poate insamanta esantioanele biologice intr-o maniera circulara sau exponentiala. Instrumentul este echipat cu sistem automat de curățare și dezinfectare. |
| Sistem de cuntificare a coloniilor Scan500 | Instrumentul Scan500 este un sistem automat de numărare a coloniilor bacteriene de pe plăcile Petri. Este echipat cu LED-uri pentru vizualizarea coloniilor bacteriene. Imaginea este captată cu o cameră CCD, iar analiza imaginii este efectuată cu software-ul inclus. Rezultatele pot fi salvate ca fișier pdf pentru arhivare. |
| Termostat | Echipamentul este un incubator programabil, pentru temperaturi cuprinse între 20 și 60°C. Este utilizat în principal pentru cultivarea microorganismelor, la o temperatură optimă. |
| Agitator MaxQ 416 HP Orbital | Agitatorul orbital MaxQ 416 HP este un instrument programabil pentru cultivarea microorganismelor, în condiții de agitare. Este echipat cu mai multe accesorii pentru adaptarea diferitelor vase de cultură. |
| Ultracongelator THERMO SCIENTIFIC 8605, -86°C | Ultra-congelatoarele sunt realizate din oțel, acoperite epoxidic în exterior și din oțel inoxidabil în interior, usi solide realizate cu aceeași izolație și material ca structura și avand un sistem de blocare de securitate, panou digital de control al temperaturii. |
| Recipient azot lichid THERMO SCIENTIFIC BioCane 47/Locator 4/Arctic Express 5 | Recipientele de azot lichid pot fi utilizate pentru a reduce rapid temperaturile probelor, pentru a menține probele la temperaturi foarte scăzute și pentru a crea un mediu de testare a produselor. Azotul lichid (LN2), pentru versatilitatea sa, este unul dintre cele mai populare lichide criogenice utilizate în laborator. Unitățile medicale, atât de cercetare, cât și de asistență medicală, utilizează în mod obișnuit azot lichid pentru depozitarea, manipularea și expedierea probelor biologice. Azotul criogenic are avantaje față de congelatoarele mecanice datorită vitezei și capacității sale de a limita cristalele de gheață ascuțite în țesut și celule care se pot forma prin alte metode. |
| Sistem de secventiere Illumina NextSeq 550 | Sistemul de secventiere Illumina NextSeq 550 este o soluție unică, care asigură o tranziție fără probleme între secvențierea “high-throughput” și scanarea matricii. Caracteristicile de secvențiere și caracteristicile de scanare a matricelor sunt reunite pentru a oferi cea mai bună soluție pentru proiectele propuse. NextSeq 550 permite secvențierea exosomilor, genomilor integrali și transcriptomilor și sprijină bibliotecile TruSeq și Nextera. Analiza în timp real utilizează o analiză integrată a datelor software-ului de analiză pe instrument, care include analiza imaginii in paralel cu studiul bazei de date. În plus, NextSeq 550 vă permite să faceți tranziția de la scanarea matricei la secvențierea “high-throughput”, pe același instrument, utilizând același software de control. |
